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研究 | ERA助力建立诊断急性髓细胞性白血病耐药基因FLT3-F691L的灵敏高效的检测方法( IF:6.113)


GenDx / 2023-01-04

导读

在癌症精准医学中,灵敏且高效地检测耐药突变是必不可少的。急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia,AML)是髓系造血干/祖细胞恶性疾病,以骨髓与外周血中原始和幼稚髓性细胞异常增生为主要特征,临床表现为贫血、出血、感染和发热、脏器浸润、代谢异常等,多数病例病情急重,预后凶险,如不及时治疗常可危及生命。

在治疗AML中,FLT3耐药基因中的F691L突变对目前所有可用FLT3抑制剂表现出普遍的耐药性。然而,截至该研究之前,还没有针对FLT3-F691L的特殊检测方法。

在本研究中,Xinjie Wang和Fuling Zhou的研究团队等借助由先达基因研发的ERA 超增技术(酶促恒温扩增技术),为临床诊断耐药FLT3-F691L突变提供了一种很有前景的方法。

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研究内容


目前针对FLT3基因F691L位点突变的检测方法常用的第一代测序(FGS)方法灵敏度低,第二代测序(NGS)耗时较长。为此,Xinjie Wang和Fuling Zhou的研究团队建立了一种准确、灵敏的CRISPR检测FLT3基因F691L位点的方法。研究团队将前处理的样本在核酸释放剂中95℃孵育3min释放基因组DNA然后采用先达基因的ERA超增技术扩增基因组DNA的FLT3基因F691L区。用L691-crRNA诱导Cas12a反应检测上述ERA扩增产物,37℃、15min后即在485 nm蓝光下直接观察结果。通过对稀释质粒和120例AML患者样本的检测证实,该检测方法可以达到0.1%的灵敏度,并在40分钟内完成整个诊断过程。这种方法会在急性髓系白血病治疗应用和指导中发挥重要作用。


研究结论


本研究建立了一种高效、准确、灵敏的检测Flt3-F691L的方法。该方法基于ERA和Cas12荧光法,均在37℃下进行,不需要大型设备和昂贵的试剂。该方法可以实现对 DNA模板个位数拷贝的检测。Xinjie Wang和Fuling Zhou的研究团队等针对急性髓系白血病FLT3基因F691L突变的临床诊断提供了一种很有前途的方法。该方法将在AML治疗的早期筛查、护理点和治疗选择中发挥重要作用。


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原文:《Rapid and Sensitive Diagnosis of Drug-Resistant FLT3-F691L Mutation by CRISPR Detection(IF:6.113)》

作者:Yin Liu, Yanling Chen, Shisheng Huang, Xiaodong Ma, Xingxu Huang, Xinjie Wang and Fuling Zhou

期刊:Frontiers in Molecular Biosciences