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实验出现假阳性现象常见原因与解决方案


先达基因 / 2022-02-25

在利用ERA技术进行实验或检测时,出现无模板对照实验出现假阳性结果,可能的原因主要有污染、引物设计以及体系非特异性扩增引起。


1. 环境与试剂的污染

污染导致的假阳性现象与PCR类似,处理方法基本相同,这里着重介绍气溶胶污染及处理方法。

气溶胶是由空气与液体表面摩擦而产生的,开盖、晃动反应管及污染加样器的反复吸样都可形成气溶胶从而导致交叉污染。据计算一个气溶胶颗粒可含48000 拷贝,因此,应尤其重视由气溶胶导致污染的问题。处理方法重点在实验空间与相关仪器表面,空间熏蒸消毒可以有效去除核酸污染源,用消毒液或75%的酒精对工作区域内的物体表面进行消毒,并使用新的扩增试剂(溶解剂、激活剂等)。可能需要重复几次清洁,才能彻底清除污染。


2. 引物探针错配导致的假阳性

这类导致的假阳性的原因,一般是引物与引物,引物与探针,引物自身等的错配产生的。

这类假阳性的验证方法:

1) 去掉任意一条引物,如果还是有假阳性发生,那就说明反应中用到的引物和探针是存在错配的,最好的解决办法就是重新设计这个引物或者探针;

2) 如果没有合适位置可以重新设计,也可以通过调节每一条引物探针的用量,尽量控制假阳性的发生,具体的用量用梯度实验来确定,梯度用量调整跨度推荐在10%-20%,优先实验减量。


3. 非特异性扩增导致的假阳性

等温扩增技术皆依赖相关酶实现核酸扩增反应,此类技术有时会出现非特异扩增现象。为减少或降低非特异性扩增,一方面需要对引物探针的进行严格设计,另一方面也需要基于特定引物探针对反应体系作适当调整。

常见的几种调整方案:

1) 调整反应的反应温度与时间:产品说明书中对反应温度与时间做了推荐,但有时因设计与项目的不同,也会有一些差异,所以可以根据具体引物和探针,调整反应温度与时间,这里推荐的反应温度范围在37-42℃,反应时间范围在10min-30min

2) 调整溶解剂与激活剂的用量:产品说明书列出的反应体系中溶解剂与激活剂的用量为一般推荐用量,在具体实验过程中,为获得更灵敏的检测能力或者控制假阳性反应,激活剂和溶解剂的用量可以做适当调整。(激活剂可以在正常用量的±25%内调整;溶解剂可以在正常用量的±10%内调整)

3) 操作的熟练度与上机时间:基于ERA技术的特点,完成体系配制后,扩增反应即启动,更快的上机速度、适合的混匀力度与时间、合适的离心时间、精准的移液,这些都会对实验的最终结果产生影响,具体在说明书中已注明了,请参阅。