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研究 | 基于ERA核酸快检扩增 Cas12a 突变体,用于检测结核分枝杆菌中的链霉素耐药基因突变


先达基因市场部 / 2022-01-14

耐药结核病(TB)是一个严重的公共卫生问题,威胁着全球结核病的预防和控制。


我国是耐药结核高负担国家之一,据世界卫生组织估计,约有1/4-1/5耐多药结核病人发生在中国,耐药结核病的流行情况较为严重,2007~2008年开展的全国结核病耐药性基线调查结果显示,我国肺结核患者中耐多药率为8.3%,据此估算,我国每年新发耐多药患者12万例,占全球每年新发总数的24.0%,位列全球第二位。


而在近日,国家传染病临床研究中心研究者扩增偶联 Cas12a 突变体的模块,通过由先达基因研发的酶促恒温扩增技术(ERA技术),开发出Cas12 检测系统,可以识别更多非传统的原始间隔区相邻基序靶向序列,可以快速治疗和预防STR耐药结核病的疾病传播,有助于减少疾病传播和死亡率。



结核分枝杆菌的药敏试验是许多国家诊断耐药肺结核的金标准。但由于设备昂贵、污染率高、方法学耗时长,不利于疾病的早期诊断。耐药结核病阳性检出率低,缺乏快速、灵敏的检测方法,使大多数耐药结核病患者无法得到及时治疗。这导致疾病传播增加导致死亡人数增加,给结核病的防控带来诸多困难。


因此,迫切需要一种简单、快速、高灵敏度的耐药结核病检测方法。


而Sherlock的最吸引人的特点是实验的快速性。与传统PCR相比,酶促恒温扩增技术(ERA技术)可以将核酸扩增时间控制在30 min以内,简化了核酸扩增过程,缩短了扩增时间,且操作简单,灵敏度也可与PCR相媲美。


在此次研究中,目标基因通过ERA在基因组中扩增,并被 Cas12a RR 识别。同时,Sherlock 的单核苷酸特异性也被应用于与M.tb相关的突变。STR抗性具有高灵敏度和特异性,即使目标基因含量为总样本量的0.1%,Cas12a RR也能识别该基因。


与药敏实验和基因组测序相比,Cas12a检测系统具有更高的灵敏度和特异性,整个检测过程可在60 min内完成,在样本处理上也更有优势。这为耐药结核病患者的及时诊断和治疗带来了希望。


原文链接:https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.796916


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公司介绍    Company Introduction


苏州先达基因科技有限公司,致力于研究开发分子诊断POCT化产品与提供现场快速一体化解决方案。公司拥有全球自主知识产权酶促恒温扩增技术(ERA技术);基于此平台开发了多系列的核酸诊断试剂及其配套的便携式检测设备;产品涵盖食品安全快速检测、畜牧水产快速检测、体外分子诊断、POCT诊断试剂盒等领域。围绕公司核心扩增技术,已申请发明专利19项,3项申请全球PCT


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